Splice-Site

Splice-Site

Eine Splice-Site stellt beim Spleißen die Grenzen der Exons und Introns dar. Ihre Sequenz ist wenig konserviert, was eine Voraussage der Exons nur anhand der DNA-Sequenz fast unmöglich macht und eine große Herausforderung in der Bioinformatik darstellt. Diese Sequenzen werden durch die Spleißmaschinerie (die snRNPS, siehe Spliceosom) spezifisch erkannt und herausgespleißt.

In jedem Intron finden sich drei Sequenzbereiche die für die Prozessierung durch das Spliceosom wichtig sind: (1) die 5' splice site, (2) der Polypyrimidin-Trakt mit dem Branch-Point Adenosin und (3) die 3' Splice site.

Ein standard Intron beginnt an der 5' splice site meist mit GU und endet an der 3' Splice site meist auf AG. Es kommen jedoch häufig Abweichungen von dieser Sequenz vor. Insbesondere bei Introns, die durch das so genannte Minor-Spliceosom (siehe auch Spliceosom) prozessiert werden, tritt die Sequenz 5' AT - 3' AC auf, weshalb sie auch als ATAC-Introns bezeichnet werden.


Wikimedia Foundation.

Игры ⚽ Нужен реферат?

Schlagen Sie auch in anderen Wörterbüchern nach:

  • Splice site mutation — A splice site mutation is a genetic mutation that inserts or deletes a number of nucleotides in the specific site at which splicing of an intron takes place during the processing of precursor messenger RNA into mature messenger RNA. The… …   Wikipedia

  • splice site — the nucleotides that span the intron–exon junction in a eukaryotic primary transcript of a split gene and function in excision and splicing reactions; those at the 5′ end form the splice donor site, while those at the 3′ end… …   Medical dictionary

  • cryptic splice site — an unusual splice site with a sequence similar to that of the consensus splice site; it is usually unused but can become competitive with the normal site if either is mutated …   Medical dictionary

  • Splice-Sites — Dieser Artikel oder Abschnitt ist nicht hinreichend mit Belegen (Literatur, Webseiten oder Einzelnachweisen) versehen. Die fraglichen Angaben werden daher möglicherweise demnächst gelöscht. Hilf Wikipedia, indem du die Angaben recherchierst und… …   Deutsch Wikipedia

  • Splice — Données clés Titre québécois Nouvelle espèce Titre original Splice Réalisation Vincenzo Natali Scénario Vincenzo Natali, Antoinette Terry Bryant et Doug Taylor Pays d’origine …   Wikipédia en Français

  • Splice the mainbrace — Épissure courte : deux cordages torsadés sont connectés en repiquant chaque brin dans l autre cordage …   Wikipédia en Français

  • splice junction — see under site …   Medical dictionary

  • Cryptic splic site — cryptic splice sitesThere are four sequence elements within introns of mammalian pre mRNAs which are required for efficient splicing. These are the conserved sequence at the 5 splice junction, the invariant AG dinucleotide at the 3 splice… …   Wikipedia

  • RNA splicing — In molecular biology and genetics, splicing is a modification of an RNA after transcription, in which introns are removed and exons are joined. This is needed for the typical eukaryotic messenger RNA before it can be used to produce a correct… …   Wikipedia

  • Spliceosome — A spliceosome is a complex of specialized RNA and protein subunits that removes introns from a transcribed pre mRNA (hnRNA)segment. This process is generally referred to as splicing. CompositionEach spliceosome is composed of five small nuclear… …   Wikipedia

Share the article and excerpts

Direct link
Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”