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notI (Nocardia otitidiscaviarum) —
Vorhandene Strukturdaten: 3BVQ, 3C25 Masse/Länge Primärstruktur 383 Aminosäuren Sekundär- bis Quartärstruktur Homodimer Bezeichner Gen-Name(n) notI (Rebase) Externe IDs UniProt: Q2I6W2 Enzymklassifikation EC, Kategorie 3.1.21.4 Restriktionsenzym Reaktionsart Hydrolyse Substrat DNA Produkte Zweisträngige DNA-Fragmente mit terminalen 5'-Phosphatgruppen Das Enzym Not I ist ein Restriktionsenzym, eine Endonuklease, die DNA an einer spezifischen Stelle schneidet. Das Molekül wurde aus dem Bakterium Nocardia otitidis-cavarium isoliert und wird den TypII-Restriktionsenzymen zugeordnet. Es besitzt eine bestimmte Erkennungsstelle auf der DNA, an der es spezifisch binden und die DNA an dieser Stelle schneiden kann. Das zugehörige Gen wurde sowohl sequenziert als auch kloniert.
Erkennungssequenz Restriktionsschnitt 5'-GCGGCCGC-3' 3'-CGCCGGCG-5'
5'-GC GGCCGC-3' 3'-CGCCGG CG-5'
Bei der Durchtrennung der DNA entstehen Überhänge von Nukleotid-Sequenzen, die aufgrund ihrer Affinität zu komplementären Sequenzen als sticky ends bezeichnet werden. Im Experiment kann das Enzym durch Hitze-Denaturierung beispielsweise bei 65°C nach 20 Minuten inaktiviert werden.
Literatur
- Giedre Tamulaitiene & Virginijus Siksnys (2008): NotI is not boring In: Structure, Volume 16, Issue 4, 497-498
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