Expressed sequence tags

Expressed sequence tags

Expressed Sequence Tags (EST) sind transkribierte Nukleotidsequenzen, die gewöhnlich durch Sequenzierung einer cDNA-Bibliothek erhalten werden. Die EST-Sequenzierung wurde von dem US-amerikanischen Genetiker Craig Venter entwickelt und ist eine schnelle Methode (mit schlechter Sequenzqualität und geringen Sequenzlängen (500-800 bp)), um die exprimierten Gene einer Zelle zu erfassen.

Man gewinnt dazu aus einem Gewebe die mRNA und schreibt diese mit Hilfe einer RT-PCR in cDNA um. Daraus wird durch Klonierung eine genetische Bibliothek erstellt, aus der wahllos Klone sequenziert werden.

Da bei der EST-Sequenzierung nur die im jeweiligen Gewebe exprimierten Gene erfasst werden können, wird ein Teil der Gene nicht beachtet. Des Weiteren werden regulatorische Elemente (Promotor etc.) ebenfalls nicht erfasst.


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