Komplex V

ATP-Synthase
Oberflächendarstellung nach 1c17, 1e79, 2a7u, 1l2p
Bezeichner
Gen-Name(n)	F0, F1
Transporter-Klassifikation
TCDB	3.A.2
Bezeichnung	F-ATPase Superfamilie
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	3.6.3.14  Hydrolase
Substrat	ADP + Phosphat + H+außen
Produkte	ATP + H2O + H+innen

Das Enzym ATP-Synthase oder F_oF₁-ATPase ist ein Transmembranprotein, mit den Funktionen einer Protonenpumpe und einer ATPase. Die ATP-Synthase tritt abhängig vom Verhältnis der Substrate und Produkte entweder als ATP-verbrauchende Protonenpumpe oder als Protonen-getriebene ATP-Synthase auf. Unter physiologischen Bedingungen besteht die Hauptaufgabe des Enzyms allerdings darin, die Synthese von ATP zu katalysieren. ATP ist eine energiereiche Verbindung, deren Bildung der Zufuhr von Energie bedarf:

ADP + Phosphat → ATP ΔH = ca. 45 kJ/mol unter physiologischen Bedingungen.

Um diese Energie aufzubringen, koppelt die ATP-Synthase die ATP-Bildung mit dem energetisch begünstigten Transport von Protonen (oder anderen Ionen) entlang eines Protonengefälles über eine Membran. Die ATP-Synthase ist also ein Energiewandler, der eine Energieform in eine andere umformt. Das Enzym spielt im Stoffwechsel fast aller bekannten Organismen eine zentrale Rolle, da ATP ununterbrochen als Energieüberträger benötigt wird.

Die ATP-Synthase setzt sich aus 8 bis 20 verschiedenen Untereinheiten zusammen. Sie gruppieren sich zu zwei Komplexen:

• Der wasserlösliche Komplex F₁ katalysiert die Bildung von ATP.
• Der wasserunlösliche, in eine Membran eingebaute Komplex F_o transportiert Protonen.

Das Enzym wird daher auch nach seinen beiden Untereinheiten als F_oF₁-ATPase bezeichnet.

Bedeutung und Vorkommen

Abb. 1: Prinzip der ATP-Synthase.

Praktisch alle Vorgänge in Organismen erfordern Adenosintriphosphat (ATP). Es stellt allen möglichen Stoffwechselvorgängen Energie zur Verfügung. Der größte Teil des verbrauchten ATP wird bei Tieren, Pflanzen und den meisten Bakterien durch die ATP-Synthase regeneriert. Der Tagesumsatz an ATP beträgt beim Menschen teilweise weit über 80 Kilogramm.

Die ATP-Synthase alias F-Typ-ATPase kommt vor

• in der Plasmamembran von Prokaryoten („Bakterien“)
• in der inneren Mitochondrienmembran von Eukaryoten (Zellen von Pflanzen und Tieren).
• in der Thylakoid-Membran der Chloroplasten von Pflanzenzellen.

Urtümliche Bakterien aus dem Reich der Archaeen haben eine A-Typ-ATPase, die im Aufbau etwas von der „normalen“ ATP-Synthase abweicht. Der Grund könnte mit dem abweichenden Aufbau von Zellmembran und Zellwand dieser Organismen zusammenhängen.

ATP-Synthasen nutzen die Energie eines Ionengradienten, der zwischen den beiden Seiten der Membran existiert. In der Regel handelt es sich dabei um einen Protonengradienten. Bei alkaliphilen Bakterien existiert auch eine ATP-Synthase, die statt eines Protonen- einen Natrium-Gradienten zur ATP-Synthese verwendet. (EC 3.6.3.15)

Geschichte

Die Aufklärung von Funktion und Mechanismus der ATP-Synthase wurde im wesentlichen von Forschern geleistet, die sich mit Mitochondrien beschäftigten. Obwohl dieses Enzym auch bei der Photosynthese der Pflanzen und bei aeroben Bakterien eine wichtige Rolle spielt, geriet die ATP-Synthase als Bestandteil der Zellatmung und der Atmungskette des Menschen in den Fokus der Biochemie.

Abb. 2: Veraltetes Modell der Atmungskette.

Der Komplex V

Anfang der 60er Jahre des 20. Jahrhunderts konnte die Biochemie auf enorme Fortschritte zurückblicken. Der Energiestoffwechsel war in ein paar Jahrzehnten fast aufgeklärt worden. Der Zitronensäurezyklus war bekannt, ebenso die physiologische Rolle von NADH als Wasserstoff-Überträger und die Rolle von ATP als Energielieferant.

Man wusste, dass der NADH-Wasserstoff mit Sauerstoff zu Wasser oxidiert wird. Und es war klar, dass bei diesem Prozess die Hauptmasse des in der Zelle benötigten ATP entsteht. Darüber hinaus wusste man, dass die Oxidation des NADH in Schritten verläuft. Man hatte in den Mitochondrien-Membranen Enzyme und Coenzyme gefunden, die eine Elektronentransport-Kette vom NADH zum Sauerstoff bilden.

Die Aufklärung dieser sogenannten Atmungskette gestaltete sich indes zunehmend schwieriger. Die Enzyme der Atmungskette ließen sich nur schwer isolieren und untersuchen, da es sich um Membranproteine handelt. Zusätzlich bilden sie große Enzym-Komplexe. Vier dieser Komplexe wurden (und werden) immer weiter aufgeklärt. Komplex V, der ATP bildet, blieb auch nach Isolierung seiner wasserlöslichen Komponente im Jahr 1961 im Dunkeln. Die Aufklärung der Atmungskette, und damit die Biochemie überhaupt, hatte also noch einen „Schönheitsfehler“.

Aus den Forschungen über den Zuckerabbau (Glycolyse) kannte man immerhin bereits einen Mechanismus (Substratkettenphosphorylierung), bei dem aus ADP und Phosphat ATP entsteht. Man zog den Schluss, dass es sich in der Atmungskette irgendwie ähnlich verhalten müsste und glaubte, dicht vor der endgültigen Aufklärung zu sein. Es fehlte „nur noch“

• die genaue Verbindung der Komplexe I-IV zur ATP-Synthese, also die Kopplung von O₂-Verbrauch und ATP-Bildung
• die Erklärung, warum der gefundene Komplex V zwar ATP spaltete, aber keines herstellte, sobald man ihn isoliert hatte
• ein „energiereiches Zwischenprodukt“ der Atmungskette als Substrat der ATP-Synthase

Es fehlte also „nur noch“ der gesamte Zusammenhang zwischen NADH-Oxidation und ATP-Produktion. Aber man hatte schon einen bis heute gültigen Namen für den Stoffwechsel-Weg: oxidative Phosphorylierung.

In dieser Situation stellte Peter Mitchell 1960 eine Hypothese vor, die lange heftig angefeindet wurde. Denn Mitchell postulierte einen für die damalige Biochemie „unvorstellbaren“ Mechanismus.

Abb. 3: Prinzip der Atmungskette nach der chemiosmotischen Theorie.

Die Mitchell-Hypothese

Mitchell selbst hatte zwar seit Beginn der vierziger Jahre schwerpunktmäßig die Atmungskette untersucht, aber kannte auch die Forschungsergebnisse der Transportvorgänge an Membranen. Seine Arbeitsgruppe konzentrierte sich bei der Untersuchung der Atmungskette auf den Elektronenüberträger Ubichinon (Q-Zyklus). Die Ergebnisse waren mit der Idee eines „energiereichen Zwischenprodukts“ der Atmungskette als Motor der ATP-Synthase nicht vereinbar. Mitchell postulierte statt dessen, dass das Enzym seine Energie von einem pH-Gradienten bekommt. (Siehe Abb. 3)

Die Ablehnung der Fachwelt war überwältigend. Selbst als Mitchell 1978 für seine chemiosmotische Theorie den Nobelpreis (Chemie) bekam, sprachen namhafte Biochemiker noch abwertend von der „Mitchell-Hypothese“.

Die Aufklärung des Mechanismus

Auch Wissenschaftler, die der „Mitchell-Hypothese“ offiziell sehr skeptisch gegenüberstanden, zogen bei ihrer Forschung im Labor die chemiosmotische Theorie ernsthaft in Betracht. Während sich die Beweise für Mitchells Theorie häuften, kam man auch im experimentellen Umgang mit der ATP-Synthase weiter. In Membranvesikeln konnte man sie „in action“ studieren.

Paul D. Boyer, ursprünglich ein „Mitchell“-Skeptiker, klärte den molekularen Mechanismus der ATP-Synthase auf. John E. Walker und Mitarbeitern gelang es, die ATP-Synthase zu kristallisieren und ihre räumliche Struktur aufzuklären. Beide bekamen dafür den Nobelpreis 1997 im Fach Chemie. Sie teilten sich den Preis mit Jens C. Skou, der bereits 1957 die erste Protonenpumpe entdeckt und damit die Grundlage für die „Mitchell-Hypothese“ gelegt hatte.

Stellung zu anderen Enzymen

Eine Vielzahl von Enzymen verbraucht das ATP, das von der ATP-Synthase geliefert wird, als Kosubstrat. Unter den Enzymen nimmt die ATP-Synthase also eine Schlüsselstellung ein.

Von den übrigen ATPasen unterscheidet sich die ATP-Synthase in verschiedener Hinsicht:

• Sie ist die Hauptquelle des ATP. Mit ihrer Funktion als ATP-Produzent unterscheidet sich die ATP-Synthase von den übrigen (durchweg) ATP-verbrauchenden ATPasen etwa wie ein Stromgenerator von einem Elektromotor.
• Sie besteht aus den beiden Untereinheiten F_o und F₁. Ihre Funktion erfordert beide Einheiten in einer spezifischen Anordnung. Man bezeichnet die ATP-Synthase daher oft auch als F-Typ-ATPase. Im Unterschied dazu sind die ATP spaltenden ATPasen V-Typ-ATPasen.
• Wie alle ATPasen kann die ATP-Synthase prinzipiell auch als Protonenpumpe fungieren und dabei ATP verbrauchen. Dass diese „Rück“-Reaktion in vivo in Mitochondrien eine große Rolle bei der ATP-Synthase spielt, ist allerdings fragwürdig. Die ATP-Synthase hat ein anderes „Übersetzungsverhältnis“ als die Protonenpumpen-ATPasen. Letztere pumpen pro verbrauchtem ATP ca. zwei Protonen nach außen. Bei der ATP-Synthase würde sich die Energie eines ATP-Moleküls dagegen auf drei bis vier Protonen verteilen. Als Protonenpumpe könnte die ATP-Synthase also keinen so großen pH-Gradienten aufbauen.

Die ATP-Synthase hat entsprechend der IUBMB Enzym-Nomenklatur die EC-Nummer 3.6.3.14 und gehört zur Kategorie der Hydrolasen.

Bauplan der ATP-Synthase

Entsprechend ihrer Stellung zur Membran (Abb. 4, unten, heller Bereich) unterscheidet man eine membrangebundene F_o- und eine wasserlösliche F₁-Untereinheit.

Mechanisch gesehen lässt sich das Enzym in einen sich drehenden Rotor (Abb. 4, rötlich bis violett) und einen Stator (Abb. 4, grün) gliedern.

Wegen des flüssigen Charakters der Membran führt der Stator eine Drehbewegung gegenläufig zum Rotor aus.

Nachfolgend wird der Bauplan der ATP-Synthase des Bakteriums E. coli beschrieben, weil sie intensiv untersucht und relativ einfach gebaut ist.

Abb. 4: Vereinfachtes Modell der ATP-Synthase von E. coli. Bezeichnet sind die Untereinheiten des Enzyms.

Aufbau von F_o

F_o besteht aus hydrophoben Peptiden (wasserunlöslichen Eiweißketten) und befindet sich in der Membran. Dieser Teil des Enzyms setzt sich zusammen aus drei verschiedenen Untereinheiten:

• F_oa dient zur Kraftübertragung auf F_ob und ist gleichzeitig Teil des Mechanismus, der die Protonenbewegung in eine Drehbewegung umsetzt.
• F_ob verbindet Membran und die F₁ Komponente. F_ob dient der Kraftübertragung und besteht wie F_oa aus zwei Peptidketten.
• F_oc besteht bei E. coli aus zwölf Spiralen, die zu einem Ring angeordnet sind. Im Inneren des Rings befinden sich vermutlich die Phospholipide, aus denen auch die Zellmembran zusammengesetzt ist. Sie bildet eine isolierende Schicht, so dass dort kein Protonenfluss möglich ist.

Jede F_oc-Peptidkette verfügt über ein aktives Zentrum. Wenn von diesem Zentrum H⁺ abgespalten wird, dann ändert sich die Struktur der Peptidkette in einen mechanisch angespannten Zustand. Nimmt das aktive Zentrum dann wieder ein H⁺ auf, dreht sich die Peptidkette zurück. Diese Drehung übt eine Kraft auf F_oa aus.

Abb. 5: Motor der Drehbewegung bei der ATP-Synthase.

Aufbau von F₁

F₁ ist die wasserlösliche Komponente der ATP-Synthase. Sie befindet sich auf der Innenseite der Membran. Fünf verschiedene Peptide (α bis ε) bilden die Untereinheiten dieser Komponente:

• Je drei F₁α und F₁β -Peptide bilden den F₁(αβ)₃Komplex. Seine gelegentlich noch verwendete Bezeichnung als globuläre (αβ)₃-ATPase weist darauf hin, dass hier die Umsetzung von ADP zu ATP stattfindet. Zwischen den Peptiden existieren insgesamt drei Poren, durch die Substrat und Produkt ein- und austreten können. In drei katalytischen Zentren wird im Inneren des F₁(αβ)₃Komplexes das ATP produziert.
• F₁γ ist die drehbare Achse des Systems. Sie überträgt die Drehbewegung des in der Membran platzierten Rings zu den drei katalytischen (αβ)₃-Zentren.
• F₁δ und F₁ε sind im Bild rechts nicht dargestellt. Ersteres Peptid ist Bindeglied zwischen F_ob und dem (αβ)₃-Komplex. F₁ε verbindet vermutlich den F_oc-Ring mit der F₁γ-Achse.

Übersicht über menschliche ATPase

Die menschliche ATPase besteht aus mindestens 16 Untereinheiten, von denen zwei durch mitochondriale Gene codiert sind. Sowohl von F1γ als von F0c existieren mehrere Genloci, die verschiedene Precursor, aber identische Untereinheiten codieren.

Gen (HGNC)	Protein (UniProt)	Länge (AA)	OMIM-Eintrag	Genlocus	Bemerkung
ATP5A1	F1α1	553	[1]	18q12-q21
ATP5B	F1β	529	[2]	12p13-qter
ATP5C1	F1γ1	298	[3]	10q22-23
ATP5C2	F1γ2	?		14	Isoform
ATP5D	F1δ	168	[4]	19p13.3
ATP5E	F1ε	51	[5]	20q13.3
ATP5O	F1O	213	[6]	21q22.1-22.2	Oligomycin sensitivity conferral protein
ATP5F1	F0b	256	[7]	1p13.2
ATP5G1	F0c Isoform 1	136	[8]	17q21.32	Proteolipid P1; Untereinheit 9; Morbus Batten
ATP5G2	F0c Isoform 2	141	[9]	12q13.3	Proteolipid P2; Morbus Batten
ATP5G3	F0c Isoform 3	142	[10]	2q31.1	Proteolipid P3; Morbus Batten
ATP5H	F0d	160		17q25	Stator
ATP5I	F0e	68	[11]	4p16.3
ATP5J	F0F6	108	[12]	21q21.1	Kopplungsfaktor 6
ATP5J2	F0f	93		7q22.1
ATP5L	F0g	103		11q23.3
ATP5S	F0s	215		14q21.3	Kopplungsfaktor B

Bewegungs- und Reaktionsabläufe

Die Funktion der „molekularen Maschine“ wird hier am Beispiel der E. coli-ATP-Synthase beschrieben.

Hypothetischer Mechanismus der Drehbewegung

Der Ort des für die Bewegung zuständigen Zentrums geht aus Abb. 5 hervor. Der Mechanismus der Drehbewegung ist in Abb. 6 dargestellt.(Stand 10/2005)

Abb. 6: animierte Drehbewegung ATP-Synthase.

	Jedes Foc-Peptid aus dem Rotor-Ring hat auf Position 61 einen Asparaginsäure(ASP)-Rest. Im Ruhezustand des Motors sind, mit einer Ausnahme, die ASP-Carboxyl-Gruppen protoniert (Peptid-COOH). Beim Rotor-Peptid 1, das neben dem Stator Fob liegt, befindet sich die ASP-Gruppe neben einer Arginin-Gruppe des Stators. Deren positive Ladung kann durch ionische Wechselwirkung eine negative Ladung stabilisieren, sodass der ASP-Rest deprotoniert vorliegt (Peptid-COO−). Das negativ geladene Rotor-Peptid 1 weicht in seiner räumlichen Struktur von den übrigen Foc-Peptiden ab. In einer Haarnadelschleife hat es wie in einer Spiralfeder eine starke mechanische Spannung aufgebaut.
	Rotor-Peptid 1 nimmt ein Proton von außen auf: Peptid-COO− + H+ (außen) → Peptid-COOH (Welchen Weg das Proton nimmt ist noch nicht genau geklärt. Die Foc-Peptide schaffen vielleicht den Raum dafür, dass es bis zur entscheidenden Position 61 vordringen kann. Nach der „Single Channel Theory“ schafft das Stator-Peptid den Zugang.)
	Sobald Rotor-Peptid 1 protoniert ist, geht seine spannungsreiche Struktur wieder in den entspannten Normalzustand über. Die „Spiralfeder“ gibt ihre Energie wieder ab. Auf den Stator wird eine Kraft ausgeübt. Das Peptid dreht sich. Chemische Energie wird hier in Bewegungsenergie verwandelt. Die Drehung des Peptids 1 ist der Antrieb des Motors.
	Die Drehbewegung bringt das Peptid 1 auf die andere Seite des Stator-Arginins und dreht den Rotor-Ring.
	Nun hat Rotor-Peptid 1 dieselbe Form wie die anderen Rotor-Peptide, die keinen Stator als Nachbarn haben: protoniert und mit entspannter Spiralstruktur.
	Der Ring ist nun um 30° gedreht. Die Bewegung des Rotor-Peptids hat allerdings gleichzeitig die nächste Foc-Peptidkette 2 in den „Bann“ der positiv geladenen Arginin-Gruppe gezogen.
	Die Struktur des Peptid 2 wird in den spannungsreichen Zustand geändert. Die „Spiralfeder“ wird gespannt.
	Peptid 2 trennt sich von dem H+, das es an der Aspartat-Gruppe an Position 61 hatte. Das Proton verlässt den Ort der Handlung in Richtung innen (im Bild: nach oben). Peptide-COOH → Peptide-COO− + H+ (innen)
	Der Ausgangszustand ist wieder hergestellt. Allerdings wurde 1. durch die Drehung des Rotors Bewegungs-Energie übertragen, 2. ein Proton von Außen nach Innen durchgeschleust.

ATP-Synthese im F₁(αβ)₃-Komplex

Die eigentliche Umsetzung von ADP zu ATP ist, biochemisch gesehen, im Vergleich zur Protonen getriebenen Drehung des F_oc-Rings nichts ungewöhnliches. Es finden Struktur-Änderungen der beteiligten Peptidketten statt, die die Substrate (hier ADP und Phosphat) zur Reaktion bringen.

Im F₁(αβ)₃-Komplex gibt es drei katalytische Zentren. Sie nehmen nacheinander drei Formen an:

1. Hohe Affinität gegenüber ADP und Phosphat. Die Ausgangsprodukte ADP und Phosphat werden an das jeweilige katalytische Zentrum gebunden.
2. Hohe Affinität gegenüber ATP. Das Zentrum bekommt einen hydrophoben Charakter, der die Kondensationsreaktion zum ATP energetisch begünstigt.
3. Geöffnete Form, in der ATP ausgestoßen wird.

Der energieverbrauchende Schritt besteht darin, die geöffnete Form zu bilden, also das Reaktionsprodukt ATP aus dem Enzym zu entfernen. Genau das ermöglicht die Drehbewegung.

Die Drehung des Rotors um 360° liefert in drei Schritten drei Moleküle ATP. Da sich die „Maschine“ bei jedem Protonendurchgang um 30° dreht, werden nach diesem Modell für jedes ATP vier H⁺ verbraucht.

ATP-Synthasen bei verschiedenen Organismen

Die ATP-Synthase des Bakteriums E.coli besteht aus acht verschiedenen Proteinen. Die ATP-Synthase in den Mitochondrien der Hefe Sacharomyces cerevisiae besteht bei prinzipiell gleicher Bauweise aus 20 verschiedenen Proteinen.

Eine ganze Bandbreite (9-14) gibt es auch bei der Anzahl der F_oc-Rotor-Peptide. Aus ihnen resultieren verschiedene Mengenverhältnisse zwischen verbrauchtem H⁺ und hergestelltem ATP.

ATP-Ertrag bei unterschiedlichen ATP-Synthasen

Typ / Herkunft	Anzahl der Foc-Peptide	H+ pro ATP
Bakterien (E. coli)	12	4
Mitochondrien (Hefe)	10	3,3
Chloroplasten (Spinat)	14	4,7
Na+-ATP-Synthase	11	3,7 Na+/ATP

Andere Bezeichnungen für die ATP-Synthase

ATP-Synthetase

Streng genommen eine fehlerhafte Bezeichnung, da Synthetasen eine chemische Bindung unter ATP-Verbrauch herstellen.

ATPase

Die ATP-Synthase ist die am häufigsten vorkommende ATPase. Daher werden beide Namen oft synonym gebraucht.

F_oF₁-ATPase, H⁺-ATP-Synthase, H⁺-transporting two-sector ATPase

Formal korrekte, aber weniger gebräuchliche Bezeichnungen

F_NullF₁- alias F₀F₁-ATPase

Nicht korrekt. Der Name der F_o-Untereinheit leitet sich von Oligomycin ab. Das ist ein Gift (Inhibitor), das diese Untereinheit blockiert.

CF_oF₁-ATP-Synthase

ATP-Synthase in Chloroplasten

Weblinks

• ATP Synthase: eine prächtige molekulare Maschine
• Animation der ATP Synthase
• Biophysiker entdeckten das älteste Rad der Welt
• Die H⁺-ATPsynthase (Deutsch)
• F1Fo ATP Synthase (Englisch)
• animierte Grafik (1,5 MB)
• ATP Synthase: Overall Architecture (Molekülstrukturen, erfordert spezielles Plug-In für Browser)
• The Nobel Prize in Chemistry 1997, Paul D. Boyer: „The Binding Change Mechanism…“ (Mechanismus der ATP-Bildung)
• Paul D. Boyer: A New Concept for Energy Coupling in Oxidative Phosphorylation…
• Oxidative phosphorylation - Reference pathway (mit grafischer Darstellung im Zusammenhang zur Atmungskette und Links zu den EC-Nummern)
• Funktion der ATP-Synthase(Quicktime Video der Funktionsweise der ATP-Synthase)
• F-ATPasen bei TCDB (engl.)
• Jennifer McDowall/Interpro: Protein Of The Month: ATP Synthase. (engl.)