Aspartylprotease

Aspartatproteasen sind Enzyme, die die Peptidbindungen eines Proteins (Eiweiß) spalten können (Proteolyse), wobei ein Molekül Wasser verbraucht wird (Hydrolyse) und das Wassermolekül von der Aminosäure Asparaginsäure in Position gehalten wird, die Teil der Protease ist und gleichzeitig das katalytische Zentrum darstellt. Es handelt sich bei Aspartatproteasen durchweg um Endopeptidasen.

Klassifizierung nach UniProt/MEROPS

Das UniProt-Consortium gibt regelmäßig eine Liste der Peptidasen heraus, die diese Enzyme nach ihrer evolutionären Abstammung kategorisiert. Die Daten der Liste sind, mit hochwertiger Information versehen, in der MEROPS-Datenbank abrufbar. Eng verwandte Moleküle sind dabei in Familien zusammengefasst, deren Bezeichner aus einem Buchstaben ('A' für Aspartatproteasen) und einer Zahl bestehen. Familien wiederum gehören zu Clans, deren Familien verwandt sind. Clan Bezeichner haben statt Zahlen einen Buchstaben.^[1]

Es gibt 14 Aspartatprotease-Familien in 7 Clans (Stand: 2008), wobei dem Clan AA mit 5 Familien eine hervorragende Bedeutung zukommt.^[2]

Clan	Beschreibung	PROSITE	Exemplarisches Enzym	UniProt	Familien
AA	azidische Aspartylproteasen (nur Eukaryoten/Viren); zwei Asp um H2O gruppiert	PDOC00128	Pepsin (Homo sapiens)	P00790	A1 A2 A3 A9 A11
AB	autolytische virale Hüllproteine; nur ein Asp involviert		Nodavirus-Peptidase	P12870	A6 A21
AC	Signalpeptidasen Typ II (nur Bakterien)	PDOC00669	Signalpeptidase II (E. coli)	Q1RGH5	A8
AD	(zwei Asp)		Präsenilin-1 (Homo sapiens)	P49768	A22 A24
AE	(ein oder zwei Asp)		gpr-Peptidase (Bacillus megaterium)	P22321	A25 A31
AF	Omptin-Familie; Asp und His binden Wasser	PDOC00657	Omptin (E. coli)	P09169	A26
A-	ohne Zuordnung				A5

Wichtige Aspartatproteasen

• Pepsin (A1)
• Chymosin (Rennin, A1)
• Renin (A1)
• Präsenilin (A22)

Einzelnachweise

1. ↑ UniProt: Peptidase families: classification and list of entries.
2. ↑ MEROPS: Liste der Clans und Familien