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EcoRI 
Bändermodell mit DNA nach PDB 1QPS Vorhandene Strukturdaten: 1ckq, 1cl8, 1eri, 1qc9, 1qps, 1qrh, 1qri, 2oxv Masse/Länge Primärstruktur 276 Aminosäuren Sekundär- bis Quartärstruktur Homodimer Kofaktor 2 Mg2+ Bezeichner Externe IDs UniProt: P00642 Enzymklassifikation EC, Kategorie 3.1.21.4 Restriktionsenzym Reaktionsart Hydrolyse Substrat GAATTC (dDNA) Vorkommen Homologie-Familie ECOR1 Übergeordnetes Taxon Proteobakterien EcoRI ist ein Enzym aus der Familie der Nukleasen. Es war die erste Nuklease I aus dem Stamm R von Escherichia coli. Es findet insbesondere in der Molekularbiologie Anwendung als Restriktionsenzym. Das Enzym besteht aus einem Homodimer und schneidet doppelsträngige DNA innerhalb der palindromischen Erkennungssequenz unter Bildung eines 5'-Überhangs wie folgt:
Erkennungssequenz Restriktionsschnitt 5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'
5'-G AATTC-3' 3'-CTTAA G-5'
Diese Ausbildung eines 4-Basen-Überhangs („sticky ends“) wird in der Molekularbiologie bei der erleichterten Ligation von DNA-Fragmenten ausgenutzt. Unter bestimmten Bedingungen zeigt EcoRI eine verminderte Selektivität für die Erkennungssequenz (Star-Aktivität).
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