- Hydropathie
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Hydropathie ist ein Fachbegriff aus der Biologie, der die Eigenschaft von Molekülen beschreibt, entweder hydrophob, hydrophil oder amphiphil zu sein.
Inhaltsverzeichnis
Hydropathie Skalen
The relative frequency scale
- Abkürzung: JTT2 scale
- Von: (Jones et al. 1992)
- Bedeutung: Gibt ein Verhältnis an das sich wie folgt berechnet:
Die Häufigkeit mit der die Aminosäure in den Transmembranesegmenten auftritt geteilt durch die Häufigkeit der Aminosäure in einer großen Menge Proteine.
- Relevanz:
Gunnar von Heijne scale
- Abkürzung GvH scale
- Von: (Gunnar von Heijne)
- Bedeutung:
- Relevanz:
Kyte and Doolittle scale
- Abkürzung: KD scale
- Von: (Kyte und Doolittle 1982)
- Bedeutung:
- Relevanz:
Eisenberg consensus scale
- Abkürzung: ec scale
- Von: (Eisenberg et al. 1982)
Einteilung in:
sehr hydrophob
- → Isoleucin 3,1
- → Phenylalanin 2,5
- → Valin 2,3
- → Leucin 2,2
- → Tryptophan 1,5
- → Methionin 1,1
weniger hydrophob
- → Alanin 1,0
- → Glycin 0,67
- → Cystein 0,17
- → Tyrosin 0,18
- → Prolin -0,29
- → Threonin -0,75
- → Serin -1,1
sehr hydrophil
- → Histidin -1,7
- → Glutamat -2,6
- → Asparagin -2,7
- → Glutamin -2,9
- → Aspartat -3,0
- → Lysin -4,6
- → Arginin -7,5
Es gilt:
- G > +1 sehr hydrohob
- +1 > G > -1 weniger hydrophob
- G < -1 sehr hydrophil
augmented WW scale
- Abkürzung: aWW scale
- Von: (Jayasinghe et al. 2001)
- Bedeutung:
- Relevanz:
Goldman-Engelman-Steitz scale
- Abkürzung: GES scale
- Von (Engelman et al. 1986)
- Bedeutung:
- Relevanz:
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