Hydropathie

Hydropathie

Hydropathie ist ein Fachbegriff aus der Biologie, der die Eigenschaft von Molekülen beschreibt, entweder hydrophob, hydrophil oder amphiphil zu sein.

Inhaltsverzeichnis

Hydropathie Skalen

The relative frequency scale

  • Abkürzung: JTT2 scale
  • Von: (Jones et al. 1992)
  • Bedeutung: Gibt ein Verhältnis an das sich wie folgt berechnet:

Die Häufigkeit mit der die Aminosäure in den Transmembranesegmenten auftritt geteilt durch die Häufigkeit der Aminosäure in einer großen Menge Proteine.

  • Relevanz:

Gunnar von Heijne scale

  • Abkürzung GvH scale
  • Von: (Gunnar von Heijne)
  • Bedeutung:
  • Relevanz:

Kyte and Doolittle scale

  • Abkürzung: KD scale
  • Von: (Kyte und Doolittle 1982)
  • Bedeutung:
  • Relevanz:

Eisenberg consensus scale

  • Abkürzung: ec scale
  • Von: (Eisenberg et al. 1982)

Einteilung in:

sehr hydrophob

→ Isoleucin 3,1
→ Phenylalanin 2,5
→ Valin 2,3
→ Leucin 2,2
→ Tryptophan 1,5
→ Methionin 1,1

weniger hydrophob

→ Alanin 1,0
→ Glycin 0,67
→ Cystein 0,17
→ Tyrosin 0,18
→ Prolin -0,29
→ Threonin -0,75
→ Serin -1,1

sehr hydrophil

→ Histidin -1,7
→ Glutamat -2,6
→ Asparagin -2,7
→ Glutamin -2,9
→ Aspartat -3,0
→ Lysin -4,6
→ Arginin -7,5

Es gilt:

G > +1 sehr hydrohob
+1 > G > -1 weniger hydrophob
G < -1 sehr hydrophil

augmented WW scale

  • Abkürzung: aWW scale
  • Von: (Jayasinghe et al. 2001)
  • Bedeutung:
  • Relevanz:

Goldman-Engelman-Steitz scale

  • Abkürzung: GES scale
  • Von (Engelman et al. 1986)
  • Bedeutung:
  • Relevanz:

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