Alphalipothrixvirus

Alphalipothrixvirus
Systematik
Reich: Viren Ordnung: nicht klassifiziert Familie: Lipothrixviridae Gattung: Alphalipothrixvirus Art: Thermoproteus-Tenax-Virus 1
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: helikal Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Alphalipothrixvirus (engl.)
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NCBI Taxonomie: 341939 ICTVdB Virus Code: 00.038.0.01

Die Gattung Alphalipothrixvirus ist eine Virusgattung innerhalb der Familie der Lipothrixviridae, deren Mitglieder längliche, behüllte Bakteriophagen mit einer doppelsträngigen DNA (dsDNA) als Genom umfassen. Die bislang einzige Art der monotypischen Gattung Alphalipothrixvirus ist das Thermoproteus-Tenax-Virus 1 (TTV-1). Es hat die Archaee Thermoproteus tenax als Wirt, die als thermophiler Organismus an heißen vulkanischen Quellen und Geysiren zu finden ist.

Morphologie

Die Virionen des Thermoproteus-Tenax-Virus 1 erscheinen unter dem Elektronenmikroskop als gerade, nicht-flexible Stäbchen mit einer Länge von 410 nm und einer Dicke von 38 nm. An beiden Enden befinden sich asymmetrische Verdickungen. Zwei an den DNA-Strang gebundene Strukturproteine (VP1 und VP2 oder TP1, TP2) bilden ein helikales Kapsid, das von einer lipidhaltigen Virushülle umschlossen wird. Diese Hülle besteht – abweichend von normalen zellulären Lipiden – vorwiegend aus Glycerol-Tetraether-Lipiden, wie sie auch in der besonderen Zellmembran der Archaeen zu finden sind. Die Phosphatreste dieser Phospholipide sind nach innen gerichtet, während die Glycosylreste die Außenseite der Virushülle bilden. In die Hülle ist zusätzlich das virale Hüllprotein VP3 (TP3) eingelagert. Ein zusätzliches aber nicht genauer lokalisiertes Strukturprotein VP4 (TP4) befindet sich im Virion. Ein Virion hat eine Molare Masse von etwa 3,3 x 10⁸ Da und zeigt bei Dichtegradientenzentrifugation in Cäsiumchlorid eine Dichte von 1,25 g/cm³. Sie sind bei 100 °C noch vollständig stabil, nach Autoklavierung bei 120 °C ist stets ein Teil der Viren noch vermehrungsfähig.

Genom

Die DNA des TTV-1 hat eine Länge von 15.900  Basenpaaren (bp), von denen bislang nur etwa 13.700 bp sequenziert werden konnten. Neben den Offenen Leserahmen (ORF) für die vier Strukturproteine konnten zwei weitere für funktionelle Proteine (TPX und PTn) identifiziert werden; die meisten Gene sind bislang in ihrer Bedeutung ungeklärt. Fast alle der größeren, identifizierten ORFs befinden sich auf einem Strang der DNA. Das TTV-1 verwendet bei der Translation seiner genetischen Information nicht den üblichen Code der eukaryotischen Zellen, sondern jene besonderen Codons, die auch von seinem Wirt genutzt werden.^[1]

Systematik

• Familie Lipothrixviridae

• Genus Alphalipothrixvirus

• Spezies Thermoproteus-Tenax-Virus 1 (TTV-1)

• Subtyp Thermoproteus tenax virus 1 Stamm KRA1
• Subtyp Thermoproteus tenax virus 1 Stamm VT3

Quellen

• K. Stedman et al.: Genus Alphalipothrixvirus. In: C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004 S. 96-98
• H. Neumann, V. Schwass, C. Eckerskorn, W. Zillig: Identification and characterization of the genes encoding three structural proteins of the Thermoproteus tenax virus TTV-1. Mol. Gen. Genet. (1989) 217: S. 105-110 PMID 2505050

Einzelnachweise

1. ↑ Alternativer genetischer Code bei Bakterien und pflanzlichen Plastiden siehe The Bacterial, Archaeal and Plant Plastid Code (transl_table=11)

Weblinks

• Alphalipothrixviridae (NCBI)
• Alphalipothrixviridae (ICTV)
• Struktur und Abbildung des TTV-1 Virus databases online
• Teilsequenz des TTV-1 Thermoproteus tenax virus 1 (TTV1) genome - Nucleotide result