LTR-Retrotransposon

LTR-Retrotransposon

Unter LTR-Retrotransposons versteht man transposable (bewegliche) Elemente im Genom, die als Zwischenstufe RNA nutzen (Retroelemente) und von long terminal repeats (LTR) flankiert sind. Die LTRs sind 250-600 bp lang und in gleicher Richtung ausgerichtet (direct repeats). Zusätzlich gibt es auch entgegengesetzt ausgerichtete Sequenzwiederholungen (inverted repeats), die bei der Retrotransposition eine bedeutende Rolle spielen, aber viel kleiner sind.

Inhaltsverzeichnis

Aufbau

Typischerweise enthalten LTR-Retrotransposons ein gag- (group-specific antigen) und ein pol-Gen. Das pol-Gen codiert für ein Protein, das Aktivität für eine Reverse Transkriptase, für eine RNaseH, für eine Protease und eine Integrase besitzt.

Diverse Vertreter, wie zum Beispiel die gypsy-Familie besitzen zudem noch ein defektes Gen für ein Hüllprotein (env für envelop). Somit bestehen LTR-Retrotransposons aus den gleichen Elementen wie Retroviren, wobei die Hüllproteine entweder defekt oder deletiert sind, sodass sie als sehr nahe Verwandte der Retroviren angesehen werden können.

Bedeutende Vertreter

Wichtige Familien sind die TY1-copia-Familie in sämtlichen grünen Pflanzen (Algen bis höhere Pflanzen) und die TY3-gypsy-Familie in Samenpflanzen. LTR-Retrotransposons finden sich aber auch in Tieren.
Im menschlichen Genom machen sie circa 8,5% aus. Die größte Familie, die HERVs (human endogen retro virus) machen ca. 4,7% aus, die MaLR (mammalian apparent LTR-retrotransposon) machen etwa 3,8% aus.

Bedeutung

Für die Bedeutung siehe auch den Abschnitt im Artikel: LTR-Element.

Literatur

  • J. D. Boeke, V. D. Corces: Transcription and reverse transcription of retrotransposons In: Annu. Rev. Microbiol. 43, 1989, S. 403-34.

Wikimedia Foundation.

Игры ⚽ Нужно решить контрольную?

Schlagen Sie auch in anderen Wörterbüchern nach:

  • LTR-Element — LTR Elemente sind DNA Sequenzen, die von so genannten long terminal repeats umgeben sind, die zur Integration ins Genom nötig sind. Dazu gehören endogene Retroviren und LTR Retrotransposons. Bedeutung in der Evolution Auf Grund der repetitiven… …   Deutsch Wikipedia

  • Retrotransposon — Rétrotransposon Les rétrotransposons appartiennent à la grande famille des éléments transposables (éléments de Classe I à intermédiaire ARN). Ils correspondent à des séquences d ADN endogènes capables de se déplacer et surtout de se multiplier… …   Wikipédia en Français

  • Retrotransposon marker — Retrotransposon markersare retrotransposons that are used as cladistic markers.The analysis of SINEs – Short INterspersed Elements – LINEs – Long INterspersed Elements – or truncated LTRs – Long Terminal Repeats – as molecular cladistic markers… …   Wikipedia

  • Retrotransposon — Retrotransposons (also called transposons via RNA intermediates) are genetic elements that can amplify themselves in a genome and are ubiquitous components of the DNA of many eukaryotic organisms. They are a subclass of transposon. They are… …   Wikipedia

  • Retrotransposon — Mit dem Begriff Retrotransposon wird eine Klasse der transponierbaren DNA Sequenzen bezeichnet. Diese trägt ihren Namen aufgrund der strukturellen Ähnlichkeit zu Retroviren. Retrotransposons verwenden RNA als mobile Zwischenstufe. Sie werden in… …   Deutsch Wikipedia

  • Rétrotransposon — Les rétrotransposons appartiennent à la grande famille des éléments transposables (éléments de Classe I à intermédiaire ARN). Ils correspondent à des séquences d ADN endogènes capables de se déplacer et surtout de se multiplier dans le génome de… …   Wikipédia en Français

  • Subviral — Unter dem Begriff subzelluläre Erreger (engl. subcellular pathogens) oder subzelluläre Agentien werden verschiedene biologische Systeme zusammengefasst, die sich ohne eigenes zelluläres System und genetisch autonom vermehren können. Zu ihnen… …   Deutsch Wikipedia

  • Boudica — (also spelled Boudicca, formerly known as Boadicea, and known in Welsh culture and legends as Buddug ) (d. AD 60 or 61) was a queen of the Iceni tribe of what is now known as East Anglia who led an uprising of the tribes against the occupying… …   Wikipedia

  • Erbinformation — Als Genom oder auch Erbgut eines Lebewesens wird die Gesamtheit der vererbbaren Informationen einer Zelle bezeichnet, die als Desoxyribonukleinsäure (DNA) vorliegt. Einige Viren nutzen statt DNA RNA als Speichermedium. Das Genom enthält die… …   Deutsch Wikipedia

  • Erbmaterial — Als Genom oder auch Erbgut eines Lebewesens wird die Gesamtheit der vererbbaren Informationen einer Zelle bezeichnet, die als Desoxyribonukleinsäure (DNA) vorliegt. Einige Viren nutzen statt DNA RNA als Speichermedium. Das Genom enthält die… …   Deutsch Wikipedia

Share the article and excerpts

Direct link
… Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”