RasMol

RasMol
Entwickler	ARCiB laboratory [1]
Aktuelle Version	2.7.5[2]
Betriebssystem	Linux/Unix/Windows/Mac/BSD[3]
Kategorie	Molekulardesign
Lizenz	GPL
Deutschsprachig	nein
Offizielle Seite

RasMol ist eine Software, die es erlaubt, Makromoleküle auf grafische Weise darzustellen, beispielsweise solche, wie sie in der Protein Data Bank vorkommen. Ursprünglich wurde das Programm von Roger Sayle^[4] in den frühen 1990er-Jahren entwickelt, heute wird es aktiv von einer Community am ARCiB laboratory weiterentwickelt^[5]. In Frankreich wurde das Programm durch das Bildungsministerium empfohlen und im Unterricht an Universitäten, Fachhochschulen und Oberstufen der Schulen eingesetzt^[6].

Beispiel eines Moleküls (TRAF2 trimer PDB:1DOA) in Rasmol

Historisch gesehen war es ein wichtiges Instrument für Molekularbiologen, da das Programm es früh ermöglichte, Moleküle auf den damaligen Heimcomputern zu virtualisieren. Weil RasMol bereits auf diesen Computern lauffähig war und keine Großrechner benötigte, die wegen ihrer hohen Anschaffungskosten nicht beliebig zur Verfügung standen, wurde RasMol ein wichtiges Forschungsinstrument in der Molekularbiologie und ist es immer noch. RasMol hat eine komplexe Versionsgeschichte^[7] und steht seit der Version 2.7 unter einer Duallizenz (GPL oder unter kommerzieller Lizenz „RASLIC“). RasMol ist neben BALLView, Avogadro, Molekel, Jmol und PyMOL ein Open-Source-Programme, das Moleküle visualisieren kann. RasMol verfügt über eine eigene Scriptsprache, die von Jmol übernommen wurde - somit laufen RasMol-Scripte auch unter Jmol. Rasmol-Scripte können auch von Sirius ausgelesen werden. RasMol ist sowohl unter UNIX-Systemen, als auch unter Windows verfügbar. Unter UNIX kann es mit anderen Programmen via Tcl/Tk kommunizieren, unter Windows via Dynamic Data Exchange (DDE).

Unterstützte Dateientypen^[8]

• MDL Molfile
• MDL Molfile
• Brookhaven Protein Databank
• IEMBL Nucleotide Format
• Minnesota Supercomputer Center's XMol XYZ
• Gaussian Input File
• Rasmol script File
• Mopac Input File
• Chemical Structure Markup Language File
• MDL Transportable Graphics File
• MDL RxnFile

Weblinks

• Handbuch (englisch)

Einzelnachweise

1. ↑ http://www.openrasmol.org/
2. ↑ http://openrasmol.org/OpenRasMol.html#Software
3. ↑ http://www.rasmol.org/software/rasmol/README.html
4. ↑ http://www.rasmol.org/
5. ↑ http://www.openrasmol.org/
6. ↑ Molecular Modeling mit RasMol von Andreas Bohne und Henryette Roth
7. ↑ http://www.rasmol.org/history.html
8. ↑ http://www.chemie.tu-darmstadt.de/Fachgebiete/OC/AKSchmidt/Avimec/UE/RASMOL/Rasmol.html

Der Artikel RasMol basiert in dieser Version auf einer Übersetzung von RasMol aus der englischsprachigen Wikipedia, Version vom 19. Mai 2008, 15:14. Eine Liste der Autoren ist hier verfügbar. Der Inhalt ist unter der Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported Lizenz sowie der GNU-Lizenz für freie Dokumentation verfügbar.