Dicer

Dicer
Dicer-Homolog-Protein aus Giardia intestinalis nach PDB 2FFL
Masse/Länge Primärstruktur	1912 Aminosäuren
Bezeichner
Gen-Name	DICER1
Externe IDs	OMIM: 606241 UniProt: Q9UPY3
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	3.1.26.-  Ribonuklease
Substrat	RNA
Produkte	RNA-Stücke mit Länge 21-23 bp
Vorkommen
Homologie-Familie	Dicer
Übergeordnetes Taxon	Kiefermäuler

Dicer [ˈdaɪsɚ] (wörtlich etwa „Würfelschneider“, von engl.: to dice: „in Würfel schneiden“) ist eine Endoribonuklease, die doppelsträngige RNA und miRNA in kurze, doppelsträngige Fragmente schneidet, die als siRNAs bezeichnet werden. Diese Fragmente sind etwa 20 bis 25 Nukleotide lang und spielen bei dem Mechanismus der RNA-Interferenz die zentrale Rolle. Mutationen im DICER1-Gen sind assoziiert mit frühkindlichem Tumor (pleuroplumonales Blastom) und mehrknotiger Struma.

Dicer ist eine RNase-III-ähnliches Enzym. Es enthält zwei RNase-III-Domänen und eine PAZ-Domäne. Der Abstand zwischen diesen beiden Domänen wird durch einen Helixbereich bestimmt, dessen Länge die Länge der entstehenden siRNAs bestimmt. Dicer katalysiert den ersten Schritt der RNA-Interferenz und initiiert die Bildung des RNA-induced silencing complex (RISC), dessen Endonuklease „argonaute“ in der Lage ist, mRNA abzubauen, deren Sequenz komplementär zu der entstandenen siRNA ist.

Mithilfe von Knockout-Moosen konnte gezeigt werden, dass DCL1b, eines von vier Dicer-Proteinen von Physcomitrella, nicht für die miRNA Biogenese, sondern für das Schneiden der Zieltranskripte notwendig ist. Dies führte zur Aufklärung eines neuen Mechanismus der Genregulation ^[1].

Der Name Dicer wurde von Emily Bernstein vergeben, einer Doktorandin in der Arbeitsgruppe von Greg Hannon am Cold Spring Harbor Laboratory, die als erste Ribonuklease-Aktivität des Dicers an dsRNA zeigen konnte.

Siehe auch

• RNA-Interferenz
• RNA-induced silencing complex

Literatur

• Rossi JJ.: Mammalian Dicer finds a partner. EMBO Rep. 2005 Oct;6(10):927-9. Review. PMID 16222240

Quellenangaben

1. ↑ B. Khraiwesh, M.A. Arif, G.I. Seumel, S. Ossowski, D. Weigel, R.Reski, W. Frank (2010): Transcriptional Control of Gene Expression by MicroRNAs. Cell 140,111-122. [1]