- Virenklassifikation
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Die Klassifikation von Viren beruht auf verschiedenen strukturellen, epidemiologischen oder medizinischen Merkmalen. Von der rein funktionellen Klassifikation ist jedoch die offiziell gültige Taxonomie von Viren zu unterscheiden, nach der Viren beispielsweise in Familien, Gattungen und Arten eingeteilt werden. Alle anderen Klassifikationen sind zum Teil aus historischen oder praktischen Gründen zum Teil noch üblich. Die Entscheidung über Kriterien der Taxonomie und Einteilung von Viren trifft ein internationales Gremium mit dem Namen International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).
Inhaltsverzeichnis
Das klassische System der Virusklassifikation
Im Jahre 1962 wurde von André Lwoff, Robert W. Horne und Paul Tournier entsprechend der von Carl von Linné begründeten binären Klassifikation der Lebewesen eine Taxonomie der Viren eingeführt.
In ihr werden analog zur Taxonomie anderer Lebewesen, die folgenden Taxa unterteilt:
- Genom-Gruppe
- Ordnung (…virales)
- Familie (…viridae)
- Unterfamilie (…virinae)
- Gattung (…virus)
- Art (<Krankheit> virus)
- Gattung (…virus)
- Unterfamilie (…virinae)
- Familie (…viridae)
- Ordnung (…virales)
Die entscheidenden Charakteristika für diese Klassifikation waren:
- 1. die Natur des viralen Genoms (DNA oder RNA)
- 2. die Symmetrie des Kapsids
- 3. Vorhandensein einer Lipidumhüllung
- 4. Größe von Virion und Kapsid
Virustaxonomie nach ICTV
Wichtige Kriterien dieser derzeitig international modernsten und anerkanntesten Virustaxonomie sind unter anderem:
- die Genomstruktur (DNA, RNA, einzelsträngig, doppelsträngig, Polarität, linear, zirkulär, segmentiert)
- die Form (Symmetrie) des Kapsids
- das Vorhandensein einer Hülle
- Anordnung der Gene innerhalb des Genoms
- Replikationsstrategie
- Virusgröße
Für die Taxonomie unberücksichtigt, aber dennoch für die Zusammenfassung unterschiedlicher Viren mit gemeinsamen medizinischen oder epidemiologischen Merkmalen wichtige Kriterien sind:
- gemeinsame Organismen, die sie infizieren
- gemeinsame Übertragungswege (z. B. Übertragung durch Gliederfüßer: Arboviren)
- ähnliche Krankheitsbilder bzw. Infektion des gleichen Organs (z. B. Hepatitis-Viren)
Ausführlicher siehe unter Virus-Taxonomie
Die Baltimore-Klassifikation
Auf Grundlage des Wissens um die Molekularbiologie der Viren hatte sich eine weitere Klassifikation vorübergehend etabliert, welche auf einen Vorschlag des Nobelpreisträgers David Baltimore von 1971 zurückgeht.
Die verschiedenen Möglichkeiten ergeben sich dadurch, dass ein Strang der doppelsträngigen DNA, so wie sie in allen anderen Lebewesen vorliegt, redundant ist und daher entfallen kann. Ebenso kann das Virusgenom auch in verschiedenen Formen der RNA vorliegen, die in Zellen als Zwischenstufe bei der Proteinsynthese auftreten. Bei einzelsträngiger RNA kommen beide möglichen Kodierungsrichtungen vor. Die normale Richtung 5'->3', die als (+) Polarität bezeichnet wird, wie sie in der mRNA vorliegt, und die entgegengesetzte (komplementäre) Richtung (-), in der die RNA quasi als Negativ vorliegt. Die Baltimore-Klassifikation nach der Replikationsstrategie wird heute zunehmend ungebräuchlich und ist nahezu durch die Taxonomie des ICTV verdrängt.
Die Zusammenfassung in Ordnungen ist recht neu. Es gibt daher bisher nur 3 Ordnungen, und viele Familien sind noch keiner Ordnung zugeordnet. Derzeit sind ca. 80 Familien und ca. 4000 Arten bekannt.
Baltimore-Gruppe I
Doppelstrang-DNA – dsDNA. Normale Genom-Form allen Lebens.
- Ordnung Caudovirales. Bakteriophagen mit schwanzartigem Fortsatz. Familien:
- Myoviridae
- Podoviridae
- Siphoviridae
- Poxviridae
- Chordopoxviridae
- Orthopoxvirus
- Parapoxvirus
- Avipoxvirus
- Capripoxvirus
- Leporipoxvirus
- Molluscipoxvirus
- Yabapoxvirus
- Entemopoxviridae
- Entemopoxvirus A
- Entemopoxvirus B
- Entemopoxvirus C
- Chordopoxviridae
- Herpesviridae
- Alphaherpesvirinae
- Simplexviren
- Herpes-simplex-Virus 1 (HSV-1) oder (HHV-1)
- Herpes-simplex-Virus 2 (HSV-2) oder (HHV-2)
- Herpes-B-Virus=(Herpesvirus simiae)
- Varicellaviren
- Varizella-Zoster-Virus (VZV) oder (HHV-3)
- Pseudowut-Virus (Aujeszky-Virus)
- Simplexviren
- Betaherpesvirinae
- Cytomegalieviren
- Humanes-Zytomegalie-Virus (HZMV) = Humanes-Cytomegalie-Virus (HCMV) = Humanes-Herpes-Virus 5 (HHV-5)
- Bovines-Cytomegalie-Virus = Bovines-Herpes-Virus 4 (BHV-4)
- Felines-Cytomegalie-Virus = Felines-Herpes-Virus 2 (FHV-2)
- Muromegalieviren
- Maus-Cytomegalie-Virus = Maus-Herpes-Virus 1 (MHV-1)
- Reseoloviren
- Humanes-Herpes-Virus 6 (HHV-6)
- Humanes-Herpes-Virus 7 (HHV-7)
- Cytomegalieviren
- Gammaherpesvirinae
- Lymphocryptoviren
- Epstein-Barr-Virus (EBV) = Humanes-Herpes-Virus 4 (HHV-4)
- Rhadinoviren
- Humanes-Herpes-Virus 8 (HHV-8)
- Lymphocryptoviren
- Alphaherpesvirinae
- Hepadnaviridae
- Orthohepadnaviren
- Hepatitis-B-Virus (HBV)
- Orthohepadnaviren
Baltimore-Gruppe II
Einzelstrang-DNA – ssDNA. Enthält DNA positiver Polarität.
- Parvoviridae
- Parvovirinae
- Dependovirus
- Adenoassoziiertes Virus-2 (AAV-2)
- Adenoassoziiertes Virus-3 (AAV-3)
- Adenoassoziiertes Virus-5 (AAV-5)
- Erythrovirus
- Parvovirus
- Porcines Parvovirus
- Felines Parvovirus
- Canines Parvovirus
- Dependovirus
- Densovirinae
- Densovirus
- Iteravirus
- Contravirus
- Parvovirinae
Baltimore-Gruppe III
Doppelstrang-RNA – dsRNA
- …
- Reoviridae
- Rotavirus
- Coltivirus
- Orbivirus
- Birnaviridae
Baltimore-Gruppe IV
Positive Einzelstrang-RNA – ss(+)RNA. Sie wirkt direkt als mRNA.
- Arteriviridae
- Togaviridae
- Alphaviren
- Chikungunya-Virus (CHIKV)
- O'nyong'nyong-Virus (ONNV)
- Rubiviren
- Alphaviren
- Flaviviridae
- Hepacivirus
- Hepatitis-C-Virus (HCV)
- GB-Virus C GBV-C (apathogen)
- Flaviviren
- West-Nil-Virus
- Dengue-Virus
- Gelbfieber-Virus
- Louping-ill-Virus
- St.-Louis-Enzephalitis-Virus
- Japan-B-Enzephalitis-Virus
- Powassan-Virus
- RSSE-Virus
- FSME-Virus
- Hepacivirus
- Coronaviridae
- SARS-assoziiertes-Corona-Virus (SARS-CoV)
- Coronaviren
- Human Corona-Virus 229E (HCoV)
- Human Corona-Virus OC43 (HCoV)
- Toroviren – Gastroenteritis
- Roniviridae
Baltimore-Gruppe V
Negative Einzelstrang-RNA – ss(-)RNA. Sie wirkt als Matrize zur mRNA Synthese.
- Ordnung Mononegavirales. RNA nicht segmentiert. Familien:
- Rhabdoviridae
- Lyssaviren
- Rabiesvirus (RABV) (Genotyp 1) = Tollwutvirus
- Lagos-Fledermausvirus = Lagos bat virus (LBV) (Genotyp 2)
- Mokola-Virus (MOKV) (Genotyp 3)
- Duvenhage-Virus (DUVV) (Genotyp 4)
- Europäisches Fledermaus-Lyssavirus = European bat lyssavirus (EBLV 1, 2) (Genotypen 5 und 6)
- Australisches Fledermaus-Lyssavirus = Australian bat lyssavirus (ABLV) (Genotyp 7)
- Lyssaviren
- Paramyxoviridae
- Paramyxovirinae
- Respiroviren
- Parainfluenzavirus (1, 3)
- Morbilliviren
- Rubulaviren
- Parainfluenzavirus (2, 4)
- Mumpsvirus
- Newcastle Disease Virus (NDV)
- Respiroviren
- Pneumovirinae
- Pneumoviren
- Metapneumoviren
- Humanes-Metapneumo-Virus (HMPV)
- Paramyxovirinae
- Filoviridae
- Marburg-Virus
- Marburg-Lake Victoria-Virus
- Ebola artige Viren (Serogruppe)
- Ebola-Zaïre-Virus
- Ebola-Sudan-Virus
- Ebola-Côte d'Ivoire-Virus
- Ebola-Reston-Virus
- Marburg-Virus
- Bornaviridae
- Rhabdoviridae
- Ordnung, RNA segmentiert. Familien:
- Orthomyxoviren
- Influenzaviren A
- Influenzavirus-A-Variante (H1N1)
- Influenzavirus-A-Variante (H2N2)
- Influenzavirus-A-Variante (H3N2)
- (avieres) Influenzavirus-A-Variante (H5N1), hoch pathogenes aviäres Influenzavirus (HPAIV)
- (avieres) Influenzavirus-A-Variante (H7N2), niedrig pathogenes aviäres Influenzavirus (LPAIV)
- (avieres) Influenzavirus-A-Variante (H7N3), niedrig pathogenes aviäres Influenzavirus (LPAIV)
- (avieres) Influenzavirus-A-Variante (H7N7), hoch pathogenes aviäres Influenzavirus (HPAIV)
- (avieres) Influenzavirus-A-Variante (H9N2), niedrig pathogenes aviäres Influenzavirus (LPAIV)
- Influenzaviren B
- Influenzavirus B/Victoria-Linie
- Influenzavirus B/Yamagata-Linie
- Influenzaviren C
- Thogotoviren
- Isaviren
- Influenzaviren A
- Bunyaviridae
- Phleboviren
- Nairoviren
- Hantaviren
- Hantaan-Virus=muerto-Canyon-Virus
- Seoul-Virus
- Psospect-Hill-Virus
- Puumala-Virus (PUU)
- Dobrava-Virus
- Tula-Virus
- Korea-Fieber-Virus
- Sin-Nombre-Virus
- Arenaviridae
- Arena-Virus
- Lassa-Virus
- lymphozytäre-Choriomeningitis-Virus (LCMV)
- Tacaribe-Virus
- Junin-Virus
- Machupo-Virus
- Arena-Virus
- Orthomyxoviren
Baltimore-Gruppe VI
Positive Einzelstrang-RNA, die in DNA zurückgeschrieben und ins Zellgenom eingebaut wird.
eine Familie
- Retroviridae
- Orthoretrovirinae
- Alpharetrovirus
- Betaretrovirus
- Gammaretrovirus
- Deltaretrovirus
- Epsilonretrovirus
- Lentivirus
- Humanes Immundefizienz-Virus Typ I (HIV-I)
- Humanes Immundefizienz-Virus Typ II (HIV-II)
- Simianes Immundefizienz-Virus (SIV)
- Felines Immundefizienz-Virus (FIV)
- Caprines Arthritis-Encephalitis-Virus (CAEV)
- Virus der equinen infektiösen Anämie (EIAV)
- Maedi-Visna-Virus (MVV)
- Spumavirinae
- Orthoretrovirinae
Baltimore-Gruppe VII
Doppelstrang-DNA, die zur Replikation einen RNA-Zwischenschritt benutzt.
- Hepadnaviridae, z. B. das Hepatitis-B-Virus
- Caulimoviridae, Pflanzenviren wie z. B. das CSSV
Nukleinsäure Kapsidsymmetrie Hülle Genom Baltimore Klasse Familie Genus Arten DNA ikosaedrisch nackt ss(+/-) II Parvoviridea Erythrovirus Parvovirus B 19 DNA ikosaedrisch nackt ds zirkulär I Papovaviridae Papillomavirus Humanes Papillomvirus DNA ikosaedrisch nackt ds zirkulär I Papovaviridae Polyomavirus SV 40, BK JC DNA ikosaedrisch nackt ds I Adenoviridae Mastadenovirus Humanes AdV A-F DNA ikosaedrisch umhüllt ds VII Hepadnaviridae Orthohepadnavirus Hepatitis-B-Virus DNA ikosaedrisch umhüllt ds I Herpesviridae Simplexvirus HSV-1, HSV-2 DNA ikosaedrisch umhüllt ds I Herpesviridae Varicellovirus VZV DNA ikosaedrisch umhüllt ds I Herpesviridae Cytomegalievirus Cytomegalievirus DNA ikosaedrisch umhüllt ds I Herpesviridae Roseolovirus HHV-6 DNA ikosaedrisch umhüllt ds I Herpesviridae Lymphocryptovirus EBV DNA komplex umhüllt ds I Poxviridae Orthopox Variolavirus, Vacciniavirus DNA komplex umhüllt ds I Poxviridae Parapox Orf RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Picornaviridae Enterovirus Poliovirus, Echovirus, Coxsackievirus RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Picornaviridae Hepatovirus Hepatitis-A-Virus RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Picornaviridae Rhinovirus Rhinivirus RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Picornaviridae Cardiovirus Mengovirus, EMC-Virus RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Astroviridae Astrovirus Astrovirus RNA ikosaedrisch nackt ss(+) IV Calciviridae Calcivirus Hepatitis-E-Virus RNA ikosaedrisch nackt ds(10–18 Segmente) III Reoviridae Coltivirus Colorado-Zeckenfieber-Virus RNA ikosaedrisch nackt ds(10–18 Segmente) III Reoviridae Reovirus Reovirus RNA ikosaedrisch nackt ds(10–18 Segmente) III Reoviridae Rotavirus Rotavirus RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) IV Togaviridae Alphavirus Sindbisvirus RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) IV Togaviridae Rubivirus Rötelnvirus RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) IV Flaviviridae Flavivirus Gelbfieber-Virus, Hepatitis-C-Virus RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) VI Retroviridae HTLV-Retrovirus HTLV RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) VI Retroviridae Spumavirus Spumavirus RNA ikosaedrisch umhüllt ss(+) VI Retroviridae Lentivirus HIV RNA helikal umhüllt ss(+) IV Coronaviridae Coronavirus Coronavirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Orthomyxoviridae Influenzavirus Influenzavirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Paramyxoviridae Pneumovirus Respiratorisches Synzytialvirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Paramyxoviridae Paramyxovirus Parainfluenzavirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Paramyxoviridae Rubulavirus Mumpsvirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Paramyxoviridae Morbillivirus Masernvirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Rhabdoviridae Lyssavirus Tollwutvirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Filoviridae Filovirus Marburgvirus, Ebolavirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Bunyaviridae Bunyavirus Bunyamweravirus RNA helikal umhüllt ss(-) V Bunyaviridae Nairovirus Krim-Kongo-Virus RNA helikal umhüllt ss(-) V Bunyaviridae Phlebovirus Phlebotomus-Fieber-Virus RNA helikal umhüllt ss(-) V Bunyaviridae Hantavirus Hantaan-Virus RNA helikal umhüllt ss(-) V Arenaviridae Arenavirus LCM-Virus, Lassa-Virus Weblinks
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